dandiarchive/dandiarchive-girder

dandiarchive https://circleci.com/gh/dandi/dandiarchive/tree/master.svg?style=svg](https://circleci.com/gh/dandi/dandiarchive/tree/master)

DANDI Archive的基础设施与代码，支持学术数据存档的全流程管理与开发。

仓库文件夹说明

• ansible：部署girder-dandi-archive的Ansible代码
• docker：应用构建与部署的Docker文件
• girder-dandi-archive：Girder插件，为存档系统添加自定义端点
• test：应用端到端测试代码
• web：基于Vue.js的前端Web应用

本地开发

服务器端

安装步骤

1. 确保MongoDB本地运行
2. 创建Python3虚拟环境：

   bash
   mkvirtualenv dandiarchive --python=python3
   

3. 安装Girder插件（可编辑模式）：

   bash
   cd girder-dandi-archive
   pip install -e .
   girder build
   

运行服务器

bash
girder serve

服务器将在http://localhost:8080/启动。

初始配置

1. 创建管理员用户：访问http://localhost:8080/#?dialog=register，首个用户自动为管理员
2. 创建文件系统资产存储：访问http://localhost:8080/#assetstores

测试服务器

bash
cd girder-dandi-archive
pip install -r requirements-dev.txt
tox

Web应用

安装依赖

bash
cd web
yarn install

运行前端

确保服务器已启动后：

bash
cd web
yarn run serve

前端将在http://localhost:8085/启动。

测试前端

bash
cd web
yarn run lint

Docker部署

通过docker-compose启动全套基础设施：

bash
cd docker
docker-compose build
docker-compose up

将启动4个容器：MongoDB、Girder、Vue前端、Provision（完成初始化后退出）。

管理员凭据：用户名admin，密码letmein。部署成功后：

• Girder：http://localhost:8080
• 前端：http://localhost:8085

发布配置

dandi-publish功能需独立部署，获取其API密钥后，通过Girder的PUT /system/setting端点配置：

dandi.publish_api_url = http://localhost:12345/  # 需以斜杠结尾
dandi.publish_api_key = 你的API密钥

API密钥生成参考https://github.com/dandi/dandi-publish#api-authentication%E3%80%82