openeuler/interproscan

InterProScan Docker镜像文档

快速参考

• 官方InterProScan Docker镜像。
• 维护者：openEuler CloudNative SIG。
• 获取帮助：openEuler CloudNative SIG、openEuler社区。

镜像概述和主要用途

InterProScan是由欧洲生物信息学研究所（EBI）开发的基因组规模蛋白质功能分类工具。InterPro整合了多个合作伙伴资源提供的蛋白质功能预测信息，可全面展示蛋白质所属家族、包含的结构域及功能位点。该工具以集成方式运行InterPro成员数据库的扫描算法，处理FASTA格式提交的新型蛋白质或核苷酸序列。

核心功能和特性

• 集成扫描多个成员数据库，包括Pfam、SMART、ProSite、Gene3D等。
• 从序列数据中识别蛋白质家族、结构域和功能位点。
• 支持蛋白质和核苷酸（CDS）FASTA输入格式。
• 提供多种输出格式，包括TSV、XML、GFF3、JSON和HTML。
• 可扩展并行处理能力，适用于大规模基因组注释任务。

更多信息请访问[***]

支持的标签及对应Dockerfile链接

每个InterProScan Docker镜像的标签由InterProScan版本和基础镜像版本组成，详情如下：

使用方法

前提条件

确保已安装Docker，或在Windows系统上使用适用于Linux容器的Docker。

获取InterProScan镜像（选择一种方式）

• 从DockerHub拉取预构建镜像：

  bash
  docker pull docker.xuanyuan.run/openeuler/interproscan:5.77-108.0-oe2403sp3
  

• 或从源码本地构建镜像：

  bash
  docker build -t openeuler/interproscan:5.77-108.0-oe2403sp3 5.77-108.0/24.03-lts-sp3/
  

运行容器

启动InterProScan环境：

bash
docker run -it docker.xuanyuan.run/openeuler/interproscan:5.77-108.0-oe2403sp3

验证安装

在容器内执行以下命令验证安装：

bash
interproscan.sh --version

问题与反馈

如遇问题或需使用特殊功能，请在openeuler-docker-images提交issue或pull request。