afanlife/r-executor

R-Executor

github：https://github.com/AFAN-LIFE/R-Executor

Author: AFAN (WeChat: afan-life)

镜像概述

R-Executor是基于Docker的R语言执行环境，集成了R运行时和Python Flask服务。用户可通过HTTP请求向r-executor容器发送R代码执行并获取结果，旨在提供跨平台R语言调用方案，简化R代码的远程执行与结果获取流程。

核心功能

• Flask集成：在R Docker环境中嵌入Flask服务，构建可远程调用的R执行服务。
• 数据类型转换：利用rpy2将R数据类型转换为标准Python数据类型，支持HTTP结果解析。

使用场景

• 远程R代码执行：无需本地安装R环境，通过HTTP接口调用执行R代码。
• 数据分析服务：为应用提供R语言的统计建模、可视化等数据分析能力。
• 教学与测试：快速搭建R执行环境，用于教学演示或代码功能验证。

配置说明

获取镜像

从Docker Hub拉取镜像

r-executor镜像已发布至Docker Hub，可直接拉取：

bash
docker pull docker.xuanyuan.run/afanlife/r-executor

镜像地址：https://hub.docker.com/r/afanlife/r-executor
镜像预装Python 3.13.2、R 4.4.2及requirements.txt、r_packages.txt中列出的依赖。容器内通过卷挂载执行app.py，可直接修改无需重建镜像。

重建镜像

若默认版本不满足需求，可修改相关文件后重建：

• 修改Python/R版本：编辑Dockerfile。
• 调整依赖：修改requirements.txt（Python）和r_packages.txt（R）。 重建命令：

bash
docker build -t r-executor:1.0 .

镜像导出/加载命令：

bash
docker save -o r-executor.tar r-executor
docker load -i r-executor.tar

启动容器

将当前目录所有文件映射至容器/app目录并启动服务：

手动启动

bash
docker run -it -p 5000:5000 -v .:/app docker.xuanyuan.run/afanlife/r-executor /bin/bash
python app.py

使用Docker Compose

bash
docker compose up

测试案例

启动app.py

root@9f2585313bab:/app# Python app.py
3.5.17
 * Serving Flask app 'app'
 * Debug mode: on
WARNING: This is a development server. Do not use it in a production deployment. Use a production WSGI server instead.
 * Running on all addresses (0.0.0.0)
 * Running on http://127.0.0.1:5000
 * Running on http://172.17.0.2:5000
Press CTRL+C to quit
 * Restarting with stat

运行test1_basic.py（基础数据类型测试）

json
{
  "data": {
    "dataframe": {
      "a": [1.0, 2.0],
      "b": ["x", "y"]
    },
    "matrix": [1, 2, 3, 4],
    "vector": [1.0, 2.0, 3.0]
  },
  "message": "R code run success",
  "status": "success"
}

运行test2_lrm.py（逻辑回归模型测试）

json
{
  "data": {
    "accuracy": [0.991],
    "model_summary": [
      "Logistic Regression Model", "",
      "lrm(formula = Heart_Disease ~ ., data = r_df)", "",
      "                       Model Likelihood     Discrimination    Rank Discrim.    ",
      "                             Ratio Test            Indexes          Indexes    ",
      "Obs          1000    LR chi2     238.07     R2       0.859    C       0.997    ",
      " 0            968    d.f.             4    R2(4,1000)0.209    Dxy     0.994    ",
      " 1             32    Pr(> chi2) <0.0001    R2(4,92.9)0.919    gamma   0.994    ",
      "max |deriv| 2e-05                           Brier    0.007    tau-a   0.062    ", "",
      "               Coef      S.E.    Wald Z Pr(>|Z|)",
      "Intercept      -109.6707 24.8000 -4.42  <0.0001 ",
      "Age               0.4953  0.1116  4.44  <0.0001 ",
      "Blood_Sugar       0.5558  0.1228  4.52  <0.0001 ",
      "Blood_Pressure    0.0135  0.0213  0.63  0.5270  ",
      "Weight            0.0647  0.0307  2.11  0.0352  ", ""
    ]
  },
  "message": "R code run success",
  "status": "success"
}

运行test3_plot.py（图表生成测试）

参考资料

• https://github.com/rocker-org/rocker/tree/master/r-base